Beállítások / Mappák résznél mindegyik helyre ugyanazt az elérési utat állítsd be.
(én pl külön partíciót használok torrent-nek, tehát: E:\ ). És mindegyik legyen bepipálva, csak a "Betöltött torrentek törlése" ne.
De ilyen minden indításnál magától újraellenörző mizériával még nem találkoztam...
Ajánlott (ha lehetőség van rá) másik (amin nem az OP van) HDD-t (vagy másik hdd-n partíciót) használni torrentnek. És nem azt a hdd-t tekertetni, amin az op is fut, vagy olyan partíciót ami egy hdd-n van az op -al.