"szóval a megjelenítésért a java applet felelne, a többiért pedig a php és az adatok frissítését az ajax oldaná meg?"
Nem. A megjelenítést HTML(+CSS) végezné, az adatok külsõ oldalról való betöltését a PHP, a tartalom frissítést (a HTML oldal <div> elemébe írogatást) pedig az AJAX.
A szöveg nem villog, mivel csak az oldal egy kis része változik.
Ha Java segítségével, vagy más nyelven (C, Delphi, Visual Basic) írod meg a programot, akkor nincs szükség PHP-re, mivel ezeken a nyelveken megoldható a külsõ oldalról való adatbevitel (sõt nem kell PHP modullal megspékelt webszervert feltenni - ez felhasználói szempontból elõnyösebb).