Minden erõmûtípusnak vannak hátrányai, több-kevesebb. A nukleáris erõforrás esetén a hátrány a magas építési költség, a fokozott biztonság miatti extra költségek, valamint az üzem bezárása után a radioaktív részegységek kezelése. Ugyanúgy, ahogy a többi erõmûtípusnál, itt is a balesetek a legveszélyesebbek. Itt általában Csernobillal riaszgatják a népet, de az egy roppant összetett szituáció volt, és minde mellett egyedi eset a maga nemében. Mûszaki hibák idõnként elõfordulnak, veszélyesek is (amerikában a 90-es években több olyan eset is volt, amikor a hûtõrendszer hibája miatt radioaktívvá vált víz szivárgott ki és került a külsõ hûtõkörbe, majd onnan a hûtõvízt biztosító folyóba, például).
Ugyanakkor nem szabad elfelejteni, hogy ez a többi energiaforrásra is igaz. Olajszármazékok esetén elég az olajvezetékek szivárgására, törésére gondolni, tengeri szállítás esetén a tankerbalesetekre, stb.