Mivel az MGS3 a múltban játszódik, s az MGS1 és 2-ben történteket nem lehet megváltoztatni ezért Snake elhalálozásával a Game Over - Time Paradox felirat tûnik fel. Ha Snake meghalna 1964-ben, akkor a korábban már elmesélt történések érvényüket vesztenék. Ezért nevezték el idõ paradoxonnak Snake halálát. Halálunkat követõen, 30 másodpercen belül cselekedhetünk, mozgathatjuk a kamerát, illetve tehetünk valami olyat, ami visszafordítja a paradoxont.
Kojima az E3-as prezentáció alkalmával felfedte, hogy elsõként asztronauta, aztán egy vadrezervátum dolgozója, végül detektív szeretett volna lenni. Többek között eme aspektusokból adódik a környezet, jelen esetben a dzsungel - és a gorillák - iránti szeretete. Beszivárgó küldetéseknél mindig a vadonból indulunk, s a túlélés formáinak prezentálásához kiváló lehetõséget nyújt a dzsungel.
Mr. Mori, a csapat katonai szakértõje, egyik nap a hegyekbe, majd az erdõségbe vitte a csapatot. Edzettek, bemutattta a kemolázsokat, illetve sokat ücsörögtek együltében. Kojima mozdulatlanul üldögélve idõvel felfigyelt a madarak csiripelésére, a közelben csörgedezõ patak hangjára... az idegesség és feszültség kevert, kimondottan egyedi érzését szeretném visszaadni a játékosoknak, amit sosem tapasztalhatnak meg a városban.
Láthattunk néhány érdekes helyszínt a demoban (melynek a megjelenése egyelõre kérdéses), Kojima azonban biztosította az EGM szerkesztõit, hogy még számos környezet lapul a tarsolyában.
A demoban hordóval üthettük ki az egyik gyanútlan õrt. Lesznek további, környezeti interkcióval kapcsolatos megoldások. A hordókat szétlõhetjük, felrobbanthatjuk vagy valami teljesen mást csinálhatunk velük. A trailerben láthattunk a speckó, tetõn, fán és egyéb anyagokon vajként áthatoló "dum-dum" golyókat akcióban. Némely szituációban kénytelenek leszünk egy golyóval két embert likvidálni, különben kiszúrnak az õrõk és megkezdõdik a hajsza.
Végezetül Big Boss, pontosabban Snake hátizsákja tágasabb, mint valaha. Közel háromszor annyi csecsebecsét cipelhetünk magunkka. A nehéz fegyverekkel viszont csínyján kell bánnunk, különben lecsökken az állóképességünk.(Hardwired)