Henry Townshend egy Silent Hill-tõl nem messze lévõ városka, South Ashfield apartmanjában lakik. Rémálmai vannak és egyik napról a másikra arra eszmél, hogy be van zárva a saját szobájába belülrõl. Az ablakok is le vannak zárva, nincs kiút a szobából. Az ajtón egy szöveg áll: "Ne menj ki! Walter". A fürdõszobában végül talál a falon egy lyukat, ahová bemászva rémálomszerû világokba kerül. A másik fõszereplõ Henry szomszédja, a szemrevaló Eileen Galvin, a játék második felében õt kell megvédeni. A sztori egész jó (bár sok a ködösítés) a fõellenség ezúttal a Silent Hillek eddigi részeiben csak újságkivágásokban felbukkanó Walter Sullivan.