Az a baj, hogy nehézkesen. A legtöbb nukleáris fegyverben plutonium a reakcióanyag, amit a hagyonányos nukleáris reaktorok nem igazán tudnak felhasználni. Hasonló a probléma az erõsen dúsított urániummal, ilyesmivel szintén nem üzemelnek reaktorok (ill. ha nem is fegyverszintû U-235-öt, de erõsen dúsított uránt használnak például a katonai tengeralattjárók kis méretû és nagy teljesítményû reaktorai).
Vannak speciális reaktorok (un. gyors szaporitó reaktorok), amelyek felhasználhatják a Plutoniumot, de ezek egyelõre elhanyagolhatóak, és fõleg az atom-nagytalmak használják õket (a gyors szaporitó reaktorok bizonyos üzemanyagok mellett gyakorlatilag nukleáris üzemanyagot gyártanak saját maguknak).
A plutoniumot fel lehet még használni az atomelemekben, mint amilyenek az ûrszondák energiaforrásai. Ezek végülis egyszerû thermoelemek, amelyek meleg oldalát a plutonium fûti.