Elõszöris chell-ként ébredünk fel újra, több száz év múltán, és próbálunk kijutni az appereture science romjaiból. A fák már benõtték az egész épületet, stb...
A lényeg hogy egy kék mag lesz a segítségünkre, aki amúgy is utálta gladost, ám véletlenül csapdába estek, és glados elé kerültök.