Az üzemanyagcellás energiaforrásokban tulajdonképpen ugyanaz történik mint minden egyes élõ sejt mitokondriumának mátrixában. A hidrogénatom egy protonra és egy elektronra "bontódik" és a belsõ membrán két külön oldalán felhalmozódnak az ellentétes töltésû részecskék. Végül a az elektronok oxigénatomra kerülnek (légzésbõl származik), majd ezekkel egyesülnek az említett protonok (hidrogén-ionok). Ezen folyamat közben nagyon nagy mennyiségû energia szabadul fel.