Ez jó kérdés, ezért kicsit utánaolvasgattam Halopedián. Az ott találtak alapján kb. ezt szedtem össze:
A Flood elleni harc során két Forerunner ("elõfutárok, õsök") expedíció indult útnak a Tejútrendszerben - messze a frontvonalak mögé - hogy minden értelmes életet dokumentáljanak a galaxisban. Eközben találtak rá a Földre. Az expedíció vezetõjében, Librarian-ben valamiért nagy tisztelet támadt az emberiség iránt, különlegesnek tartotta a többi értelmes faj közt. Annyira mély kapcsolatot alakított ki vele, hogy úgy döntött, mindenáron megvédi õket a Flood pusztításától. Ezért elpusztított minden "Kulcshajót", ami a Flood-ot a Bárkára és ezzel a Földre juttathatná (ilyen hajó pl. a Halo 2-ben a felszálló Forerunner csillaghajó). A háború menete idõközben rosszra fordult, a Flood végpusztulással fenyegetett. Didact, a Forerunner-ek katonai vezetõjének (õ volt Librarian szeretõje) nem maradt más választás, mint aktiválni a Halo-kat. De mégsem akarta megtenni: valószínûleg azért, mert Librarian még mindig a Földnél tartózkodott. Librarian megkönnyítette számára a döntést: sajá hajói önmegsemmisítõjének beindításával felrobbantotta az utolsó Kulcshajókat is, ezáltal õ a Földön ragadt, Didact pedig végre aktiválhatta a Halo-kat, ami - akkor úgy tûnt - eltörölte a Flood-ot és velük együtt az egész Forerunner fajt a galaxisból. Librarian élete végéig a Kilimandzsárón élt, a Bárkát õrizve.
A többi értelmes faj, akik késõbb a Szövetséget alkotják, legelõször is a Sangheili ("Elitek") és a San 'Shyuum ("Próféták") fajok kezdték el használni a Forerunner-ek által hátrahagyot technológiát, aminek felhasználásával elkezdték kiterjeszteni hatalmukat a Tejútrendszer Orion-ágában (ahol késõbb az ember is felbukkan), magukba olvasztva minden arra érdemes és elpusztítva minden érdemtelen fajt. Ennek során találtak rá az emberiségre is, akikrõl - a késõbb felmerülõ belsõ konfliktusok miatt - csak késõbb döntöttek úgy, hogy érdemtelenek a Szövetségbe való "felvételre", ezért egy rövid, az emberiségnek címzett üzenetet követõen megindítják irtóhadjáratukat.
Találtam még többet is errõl a témáról, de azt hiszem, így is elég hosszú lesz már ez a hsz :).