10 évvel az elsõ rész után játszódik. A várost most Sophia Lamb irányítja(elsõ részben asszem említés szintjén volt róla szó,akkor éppen börtönben volt).Eleanor Lamb -et kell megkeresnünk,akit mint az anyja, mint pedig a helyiek, mint vmi messiásként kezelik,az evolúció egy új foka.
Õ volt az a little sister 10 éve, akit hõsünkhöz, Deltához kapcsoltak pszichés síkon(azt hiszem az egyetlen sikeres), ezért az egyetlen Big Daddy-nek tekint minket,az apjának, nem úgy mint a többi little sister,akinek mindegy, hogy most melyik Mr. Bubble kísérgeti :)
Meg-meg jelenik játék közben mint vmi látomás, utasításokat,tanácsokat ad.
Szóval õt kell megkeresni
Én a jó befejezést kaptam, de kiváncsi leszek a rosszra is. 3 alkalommal van, hogy morális döntést kell hoznunk a little sisterek megmentésén/begyûjtésén kívül.