"Miért lenne mindegy az, hogy honnan jön a génszekvencia? Pont ez határozza meg a rokonságokat."
Nem, nem ez határozza meg a rokonságokat, és egy ilyen génátadás nem rokonsági kapcsolat. A rokonságot a leszármazás határozza meg, és ez nem az.
Az embernek is vannak vírusoktól szerzett génszekvenciái. Ami baromságot erõltetsz, az alapján akkor az ember rokonsági kapcsolatban áll a vírusokkal? Ne fárassz már!
"Honnan vetted, hogy el kellene tûnnie a régi fajnak?"
Egy olyan gráfvonal, ami egy fajból egy másik fajba mutat, ezt jelenti.
"És a normális törzsfejlõdésben is csak a legritkább esetben tûnik el az eredeti faj."
???? Ne kúrjál már fel! A Földön valaha élt fajok 99.999999999%-a "el van tûnve"! A fa köztes "ága" egy ma már nem létezõ fajt jelent, ami vagy átalakult másik fajjá, vagy kihalt.
Szerintem hagyjuk, ha ennyire totál el vagy tájolva, nem sok értelme van ennek a beszélgetésnek.
Egyébként én a fentiekkel szemben inkább az ilyen jellegû ábrázolást szeretem:
Csak ezen nem lehet az egész élõvilágot ábrázolni, mert az egysejtûek mellett nem látszódnának a többsejtûek, csak egy vékony csíkként...