A WinFS egy SQL adatbázis volt mely az ú.n. WinFS tárolókon tárólt fájlok között épített ki, a meta adataik, illetve bizonyos mértékben az adataik között relációs kapcsolatot, továbbá ezeken az indexelést alkalmazott elõsegítendõ a keresést valamint a relációs kapcsolatok gyorsabb kezelését. A WinFS Virtuális Könyvtárai pedig egy XML alapú lekérdezések voltak.
Ehez még hozzá jön az is, hogy a relációkat kézileg is lehet létrehozni akár brogramból, az adatbázis rekordjait lehetett bõvíteni. A Fájlokhoz kettõs hozzáférést biztosított: fájl rendszer szerû hozzá férés a \\[Számítógépnév]\[DefaultStore|WinFS tároló név]\[mappa]\[fájl] illetve T-SQL lekérdezéssel ADO.NET ujabb változatán keresztül.